Penjara Banceuy di bangun oleh pemerintah Belanda pada tahun 1877, awalnya penjara ini di peruntukkan bagi tahanan politik tingkat rendah dan kriminal.
Di penjara ini ada 2 macam sel yaitu sel untuk tahanan politik di lantai atas dan sel untuk tahanan rakyat jelata di lantai bawah. Sel penjaranya sendiri berukuran 1,5 x 2,5 meter. Inilah yang menjadi titik tolak kenapa bangunan ini bersejarah.
Pada tanggal 29 Desember 1929, Soekarno serta tiga rekan dari PNI, Maskoen, Soepriadinata, dan Gatot Mangkoepraja di tangkap di Yogyakarta dan kemudian di jebloskan ke penjara Banceuy selama kurang lebih 8 bulan.
Di sinilah Soekarno menyusun pledoi yang sangat terkenal yang kemudian di beri nama Indonesia Menggugat. Yang di bacakan di sidang pengadilan di Gedung Landraad (kini bernama Gedung Indonesia Menggugat yang terletak di Jalan Perintis Kemerdekaan).
